Bioinformatik-kort forløb - Arbejdsopgaver

Download af og introduktion til NetLogo som program (tre faneblade, settings, speed, check…).

Desuden åbning af filen med simuleringen i programmet NetLogo.

Forventet tidsforbrug: 20 min.

Introduktion til og fri leg med simulering.

Forventet tidsforbrug: 20 min.

Opgave (O)/Task (T):

T1: Start simuleringen ved at trykke "Setup". Observer hvad der sker. Tryk dernæst på "Go" og observer simuleringen.

O1: Forklar hinanden (i grupper á 2) hvad der foregår i simuleringen?. Tegn og skriv forklaringen på whiteboard. Brug gerne fagbegreber. Notér gruppens bemærkninger (f.eks. problemer med simuleringen) på whiteboardet. Tag billeder af whiteboardet og gem det på konference/mail med jeres gruppenavn i filnavnet.

T2: Orienter dig/jer i programmets muligheder. Undersøg bl.a. fanebladene (Interface, Info, Code) og "Settings".

O2: Prøv at ændre antallet af DNAbaser i den nederste DNA streng til flere.

T3: Kig i fanebladet "Code" og identificer hvor basernes farve defineres.

O3a: Der kunne være en fordel i at ændre farven på baserne, hvorfor? Forklar dette på whiteboardet. Tag et billede af whiteboardet og gem det på konference/mail med jeres gruppenavn i filnavnet.

O3b: Prøv at ændre basernes farve så man kan se den hvide ”dot” tydeligere.

T4: Orientér dig i "Code" og forsøg at få et overblik over opdeling og funktion af de forskellige afsnit.

O4: Prøv at lave en ændring i koden, som man kan se i simuleringen. Gem ændringerne fra T3 og T4 som en .nlogo fil med dit navn/gruppenavn på. Send den til konferencen/mail.

Forventet tidsforbrug: 60 min.