Bioinformatik-kort forløb

(20 min) Evt. Lektie (Arbejdsspørgsmål til: Bioinformatik og systembiologi - introduktion - af Johanne Keiding og Søren Brunak (biotechacademy.dk)) Hvad er bioinformatik Hvad kan bioinformatik bruges til? Hvilke andre fagområder er inddraget i bioinformatik?

(20 min) Intro om sammenligning af DNAsekvenser:

Om at sekventere det humane genome: TedED

Om at sammenligne DNA sekvenser: Bozeman Science (brug kun de første ca 4 minutter: fra 0:00 til 4:06).

DNA comparisons: Figur/artikel om menneskers beslægtethed med bl.a. aber: Scientific American

(20 min) Download af/Introduktion til NetLogo som program (tre faneblade, settings, speed, check…)

(20 min) Introduktion til/Fri leg med simulering:

Opgave/Task (T): T1: Forklar hinanden (2og2) hvad der foregår i simuleringen?. Tegn/skriv forklaringen på whiteboard. Brug gerne fagbegreber. Tag billeder af det. Notér gruppens bemærkninger (f.eks. problemer med simuleringen) på whiteboardet. T2: Prøv at ændre antallet af DNAbaser i den nederste DNA streng til flere. En af bekymringerne er måske problemer med farven på baserne, derfor: T3: Prøv at ændre basernes farve så man kan se den hvide ”dot” tydeligere. T4: Prøv at lave en ændring i koden, som man kan se i simuleringen. Gem ændringen fra T3 og T4 som en .nlogo fil med dit navn på. Send den til konferencen/mail.

Assessments/Evaluering: Whiteboards .nlogo-filer A1: Hvilke og hvor mange fagbegreber bruger eleverne? Bruges de i en korrekt faglig kontekst? A2: A3+A4: (kig på de “implemented changes in code”: er de succesfulde? Hvad viser de? Hvordan forholder de sig til det faglige indhold?